Menilai Risiko SARS-CoV-2 Pada Satwa Liar

Menilai Risiko SARS-CoV-2 Pada Satwa Liar

nocompromise – Virus corona baru SARS-CoV-2 kemungkinan muncul dari sumber satwa liar dengan penularan ke manusia diikuti oleh penyebaran geografis yang cepat ke seluruh dunia dan berdampak parah pada kesehatan manusia dan ekonomi global.

Menilai Risiko SARS-CoV-2 Pada Satwa Liar – Sejak awal pandemi, ada banyak contoh penularan dari manusia ke hewan yang melibatkan hewan pendamping, peternakan dan kebun binatang, dan bukti terbatas untuk penyebaran ke satwa liar yang hidup bebas. Pembentukan reservoir infeksi pada hewan liar akan menciptakan tantangan yang signifikan untuk pengendalian infeksi pada manusia dan dapat menimbulkan ancaman bagi kesejahteraan dan status konservasi satwa liar. Kami membahas potensi paparan, penularan selanjutnya, dan persistensi SARS-CoV-2 dalam seleksi awal mamalia liar (kelelawar, canid, felid, mustelid, kera besar, tikus, dan cervid). Penilaian risiko dinamis dan pengawasan yang ditargetkan adalah alat penting untuk deteksi dini infeksi pada satwa liar, dan di sini kami menjelaskan kerangka kerja untuk menyusun dan mensintesis informasi yang muncul untuk menginformasikan pengawasan yang ditargetkan untuk SARS-CoV-2 pada satwa liar. Upaya surveilans harus diintegrasikan dengan informasi dari inisiatif kesehatan masyarakat dan veteriner untuk memberikan wawasan tentang peran potensial mamalia liar dalam epidemiologi SARS-CoV-2.

Menilai Risiko SARS-CoV-2 Pada Satwa Liar

Menilai Risiko SARS-CoV-2 Pada Satwa Liar

Diperkirakan ada lebih dari 122 juta kasus infeksi manusia dengan Covid-19 secara global, dengan lebih dari 2,7 juta kematian dan penularan komunitas yang meluas di banyak negara. Spekulasi awal tentang asal mula pandemi yang berfokus pada sekelompok kasus manusia yang terkait dengan pasar makanan laut yang menjual hewan liar hidup di Wuhan, Cina meskipun bukti kasus awal lainnya pada orang yang tidak memiliki kontak dengan pasar menunjukkan kemungkinan munculnya dari lokasi lain . Virus corona penyebab (SARS-CoV-2) kemungkinan berasal dari kelelawar (lihat di bawah), meskipun spesies hewan yang bertanggung jawab untuk penularan ke manusia masih belum diketahui. Sejak awal pandemi, penularan dari manusia ke hewan (zooanthroponosis SARS-CoV-2) telah terjadi pada banyak kesempatan, di banyak negara, dan melibatkan beberapa spesies, meskipun hingga saat ini hanya ada bukti SARS-CoV yang sangat terbatas. -2 infeksi pada satwa liar yang hidup bebas . Namun, kemungkinan besar kasus lebih lanjut pada satwa liar akan muncul karena banyak virus corona memiliki kisaran inang yang luas dengan kemungkinan yang jelas bahwa spillback dari manusia dapat mengarah pada pembentukan reservoir infeksi pada mamalia liar

Mengontrol penularan patogen dari hewan liar ke manusia atau hewan peliharaan sangat menantang, dan karenanya munculnya reservoir baru infeksi SARS-CoV-2 pada satwa liar dapat secara serius menghambat pengendalian dan eliminasi penyakit yang efektif pada populasi manusia. Infeksi pada satwa liar yang hidup bebas juga akan memiliki implikasi praktis yang substansial untuk pengelolaan, penelitian, rehabilitasi dan kegiatan konservasi dan dapat menghasilkan opini publik yang negatif terhadap beberapa spesies yang mengarah pada penganiayaan dan pelepasan dari inisiatif konservasi. Ada potensi efek merugikan baik langsung maupun tidak langsung pada satwa liar dengan implikasi bagi kesejahteraan hewan, konservasi dan keanekaragaman spesies global . Kekhawatiran ini tercermin dalam panduan yang muncul tentang bagaimana mereka yang bekerja secara langsung dengan satwa liar dapat mengurangi risiko penularan SARS-CoV-2 ke mamalia liar .

Namun, ada juga kebutuhan akan langkah-langkah pengurangan risiko untuk diperluas ke orang lain di komunitas yang lebih luas yang mungkin memiliki kontak dengan satwa liar, misalnya di mana hewan liar dipanen dan diperdagangkan untuk makanan . Tindakan pencegahan semacam itu merupakan garis pertahanan pertama yang penting, tetapi dalam menghadapi infeksi yang meluas pada populasi manusia, ada kebutuhan untuk juga merencanakan implikasi dari penyebaran SARS-CoV-2 pada satwa liar yang hidup bebas. Hal ini memerlukan penilaian tentang peran potensial populasi satwa liar dalam epidemiologi infeksi, dan khususnya, identifikasi spesies tersebut dan keadaan yang paling mungkin menyebabkan reservoir infeksi. Surveilans, tindakan pencegahan dan rencana kontinjensi kemudian dapat dikembangkan dan ditargetkan dengan tepat. Berdasarkan bukti yang tersedia, peran potensial satwa liar dalam persistensi, penyebaran, dan kemungkinan kemunculan kembali SARS-CoV-2 dibahas di bawah ini, dan kerangka kerja untuk penilaian risiko dinamis dan pengawasan yang ditargetkan dijelaskan.

Asal-usul satwa liar dari SARS-CoV-2

SARS-CoV-2 adalah betacoronavirus (β-CoV), terkait erat dengan SARS-CoV dan MERS-CoV yang juga telah menyebabkan wabah penyakit yang serius pada populasi manusia. Semua diperkirakan berasal dari kelelawar , dengan bukti perantara atau jembatan host bertanggung jawab untuk transmisi ke manusia . Musang palem bertopeng ( Paguma larvata ) diidentifikasi sebagai sumber proksimal SARS (Severe Acute Respiratory Syndrome) pada manusia , dan unta dromedaris ( Camelus dromedarius ) adalah reservoir dan sumber MERS (Middle Eastern Respiratory Syndrome) pada manusia . Meskipun SARS-CoV-2 mungkin berasal dari kelelawar, nenek moyang genetik terdekatnya yang teridentifikasi (RATG13) adalah -CoV yang diisolasi dari kelelawar tapal kuda perantara ( Rhinolophus affinis ) , penyebab proksimal infeksi pada manusia belum diketahui secara pasti. diidentifikasi. Trenggiling Malaya ( Manis javanica ) telah menjadi subyek spekulasi berdasarkan infeksi virus corona yang terkait erat pada hewan yang ditangkap di Cina selatan .

Analisis urutan lonjakan glikoprotein (S) SARS-CoV-2 dan coronavirus terkait menunjukkan serangkaian peristiwa rekombinasi antara coronavirus kelelawar dan trenggiling, mungkin pada akhirnya menyebabkan munculnya coronavirus baru ini. Namun, anjing rakun (Nyctereutes procyonoides ), yang diidentifikasi sebagai hospes perantara yang mungkin untuk pandemi SARS tahun 2002-2003, juga telah diusulkan sebagai calon hospes perantara untuk SARS-CoV-2 karena infeksi eksperimental mengakibatkan pelepasan virus yang intens . Baik trenggiling dan anjing rakun telah ditemukan di pasar satwa liar di Cina Selatan, bersama dengan banyak mamalia liar lainnya (ditangkap dan diternakkan secara liar) dan spesies peliharaan. Laporan limpahan SARS-CoV-2 dari manusia ke hewan pendamping, penangkaran, dan peternakan (lihat di bawah) memberikan wawasan tambahan tentang spesies lain yang mungkin telah memfasilitasi lompatan dari satwa liar ke manusia.

Baca Juga : Mengidentifikasi Badan Amal Terbaik yang Membantu Hewan Terancam Punah?

Informasi tentang kerentanan hewan inang terhadap SARS-CoV-2 muncul dengan cepat. Ada beberapa bukti yang dapat digunakan untuk menyimpulkan kerentanan mamalia liar, termasuk prediksi berdasarkan karakteristik reseptor sel inang yang mengikat virus untuk menginfeksi sel, demonstrasi infeksi eksperimental garis sel atau individu hewan, dan konfirmasi infeksi yang didapat secara alami. Keberadaan coronavirus dengan kesamaan nukleotida di semua gen (termasuk kemungkinan nenek moyang baru-baru ini dari SARS-CoV-2) pada spesies hewan liar juga dapat berguna dalam menyimpulkan kerentanan terhadap infeksi di masa depan.

Analisis protein enzim pengubah angiotensin 2 (ACE2), reseptor fungsional untuk protein lonjakan SARS-CoV-2 pada berbagai vertebrata, telah digunakan untuk memprediksi kerentanan terhadap infeksi pada banyak spesies mamalia. Studi eksperimental menggunakan garis sel yang dimodifikasi untuk mengekspresikan ACE2 juga telah menunjukkan potensi infeksi SARS-CoV-2 pada berbagai mamalia termasuk kelelawar, tikus, cetacea, karnivora dan primata sementara kultur organ ex-vivo telah menunjukkan virus replikasi di jaringan pernapasan sapi dan domba . Prediksi berdasarkan studi tersebut tunduk pada ketidakpastian substansial dan hubungan filogenetik yang erat antara spesies inang potensial atau kesamaan dalam urutan protein ACE2 tidak cukup untuk memprediksi kerentanan terhadap SARS-CoV-2, sehingga informasi ini perlu dipertimbangkan bersama bukti lain. Selanjutnya, meskipun analisis struktural in silico dan penilaian pengikatan virus in vitro dilakukan terhadap ACE2 di banyak spesies, informasi lebih lanjut diperlukan pada tingkat dan lokasi (rongga hidung, trakea, paru-paru dan saluran gastro-intestinal) ekspresi ACE2 pada mamalia yang berbeda untuk menginformasikan penilaian kerentanan inang terhadap infeksi SARS-CoV-2.

Hasil dari studi infeksi eksperimental tersedia untuk beberapa spesies mamalia, dengan lebih banyak informasi muncul setiap hari. Studi tersebut menunjukkan kerentanan terhadap SARS-CoV-2, meskipun dengan berbagai tingkat replikasi dan pelepasan virus, pada kucing domestik ( Felis catus ) dan anjing ( Canis lupus familiaris ), musang ( Mustela putorius furo ), cerpelai Amerika ( Neovison vison ), Hamster Syria ( Mesocricetus auratus ), hamster kerdil Roborovski ( Phodopus roborovskii ), tikus rusa ( Peromyscus maniculatus ), tikus hutan ekor lebat ( Neotoma cinerea ), bank voles ( Myodes silau ), kera rhesus (Macaca mulatta ), kera cynomolgus ( M. fascicularis ), monyet hijau Afrika ( Chlorocebus sp. ), Tikus pohon Cina ( Tupaia belangeri chinensis ), marmoset umum ( Callithrix jacchus ), kelelawar buah Mesir ( Rousettus aegyptiacus ), anjing rakun ( Nyctereutes procyonoides procyonoides procyonoides ), sigung belang ( Mephitis mephitis ), rakun ( Procyon lotor ), rusa berekor putih ( Odocoileus virginianus ), kelinci laboratorium ( Oryctolagus cuniculus ) dan mencit ( Mus musculus ), dan sapi ( Bos taurus ) . Studi eksperimental telah gagal untuk menunjukkan kerentanan terhadap SARS-CoV-2 di berbagai spesies lain termasuk kelinci cottontail ( Sylvilagus sp.), tupai rubah ( Sciurus niger ), tupai tanah Wyoming ( Urocitellus elegans ), anjing padang rumput ekor hitam ( Cynomys). ludovicianus), tikus rumah ( Mus musculus ) dan kelelawar coklat besar ( Eptesicus fuscus ).

Namun, studi eksperimental tidak secara tepat meniru dinamika infeksi dan penularan selanjutnya dalam kondisi alami, dan mungkin melebih-lebihkan kerentanan, karena mereka sering berusaha memaksimalkan kemungkinan infeksi melalui penggunaan volume besar, dan inokula titer tinggi dan/atau pemberian langsung. untuk menargetkan situs. Dampak potensial dari dosis percobaan pada hasil diilustrasikan oleh tiga studi terpisah pada babi ( Sus scrofa ) dua di antaranya tidak dapat menunjukkan kerentanan meskipun penggunaan dosis yang jauh lebih tinggi pada yang ketiga menghasilkan deteksi antibodi penawar, RNA virus dan virus hidup.

Infeksi SARS-CoV-2 yang didapat secara alami telah ditunjukkan pada anjing peliharaan, kucing dan musang di lingkungan domestik, pada harimau ( Panthera tigris ), singa ( Panthera leo ), puma ( Puma concolor ), macan tutul salju ( Panthera uncia ) dan gorila dataran rendah Barat ( Gorila gorila ) dalam koleksi zoologi, dan cerpelai Amerika yang dibudidayakan. Semua kasus infeksi alami seperti itu telah dikaitkan dengan penularan awal dari manusia ke hewan dalam perawatan mereka. Ada juga kasus infeksi yang tercatat pada apa yang digambarkan sebagai kucing ‘liar’ meskipun sejauh mana mereka benar-benar hidup bebas dan tingkat kontak mereka dengan manusia tidak jelas. Infeksi yang didapat secara alami pada cerpelai liar Amerika dikaitkan dengan peternakan cerpelai terdekat di mana virus dengan genotipe yang tidak dapat dibedakan juga diisolasi.

Kontak langsung dengan inang yang terinfeksi mungkin tidak diperlukan untuk penularan SARS-CoV-2, karena penelitian telah menunjukkan potensi virus corona untuk tetap menular selama berjam-jam di beberapa permukaan dan pada kotoran manusia. Studi terbaru telah mempertimbangkan kemungkinan bahwa kontaminasi sistem perairan dengan kotoran dari manusia yang terinfeksi dapat memberikan rute untuk limpahan ke mamalia liar seperti rakun dan kelelawar, dan spesies laut termasuk cetacea dan anjing laut. Deteksi RNA virus di tempat tidur, sampel udara dan air, di kaki burung camar dan dari lalat hidup yang dikumpulkan dari peternakan cerpelai yang terinfeksi SARS-CoV-2 menunjukkan potensi pencemaran lingkungan di tempat ini.